Dunántúli Leuce nyár populációk genetikai vizsgálata RAPD és cpDNS markerekkel
Kulcsszavak:
Leuce nyárak, molekuláris genetikai változatosság, Shannon-index, RAPD, cpDNS, Nei-féle genetikai távolságAbsztrakt
A kutatás a fehér nyár és a rezgő nyár fontosabb dunántúli populációinak populációgenetikai vizsgálatát célozta. A cél e populációk genetikai változatosságának felmérése, valamint a teljes molekuláris genetikai változatosság megoszlásának vizsgálata volt. A populációgenetikai vizsgálatokban RAPD és cpDNS markerek alkalmazására került sor. A RAPD vizsgálatokba a teljes gyűjtési területet lefedő mintasorból 267, a PCR-RFLP vizsgálatba 300 egyedet vontunk be. Két, nagyfokú polimorfizmust mutató RAPD primerrel végzett vizsgálatok során a belső-somogyi állományok mutatták mindkét alapfaj esetében a legmagasabb diverzitás értékeket, a Nei-féle genetikai távolság alapján szerkesztett dendrogram ugyanakkor nem mutatott szoros kapcsolatot az egyes populációk genetikai és földrajzi távolsága között. A 4 cpDNS primerpárral végzett PCR-RFLP vizsgálat alkalmával a legmagasabb diverzitás értékeket a fehér nyárnál a kis-balatoni, a rezgő nyár populációk közül pedig a villányi populáció mutatta. A Nei-féle genetikai távolságok a cpDNS markerek esetében sem mutattak szoros kapcsolatot a populációk földrajzi távolságával. A molekuláris genetikai változatosság mindkét markerezési eljárás tekintetében a populációkon belüli varianciából ered.
Hivatkozások
Allaby, M. 2004: “Shannon-Wiener index of diversity.” a Dictionary of Ecology. 2004. Encyclopedia.com. (April 12, 2010). http://www.encyclopedia.com/doc/1O14-ShannonWienerindexfdvrsty.html
Bartha D. és Bordács S. 1990: Elektrophoretische Untersuchungen an Weißpappel-Populationen in Ungarn. Die Holzzucht, 44: 23–25.
Bartha D. 1991: Gibt es Bodenrassen bei der Weisspappel? Allgemeine Forst Zeischrift 46: 877.
Bartha D. 1999: Phänologische und taxonomische Untersuchungen bei den einheimschen Populationen der Weisspappel (Populus alba L.). Publ. Univ. Horti. Industriaeque Alimentariae 59: 85–93.
Bartha D. 2005: Ist die Graupappel eine eigene Art? Taxonomische Untersuchungen an den Populationen der Weisspappel (Populus alba L.). Allgemeine Forst Zeitschrift/Der Wald 60: 252–254.
Bisztray Gy. 2001: Molekuláris genetikai markerek. 424. In: Velich I. (ed.): Növénygenetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest Bordács S. 2002: A DNS-polimorfizmus elemzéséhez alkalmazott módszerek. 53. In: Mátyás Cs. (ed.): Erdészeti – természetvédelmi genetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest
Grivet D.; Heinze B.; Vendramin GG. and Petit RJ. 2001: Genome walking with consensus primers: application to the large single copy region of chloroplast DNA. Molecular Ecology Notes 1: 345–349.
Hajósné Novák M. 1999: A PCR-technikán alapuló módszerek. 44–48. In: Hajósné Novák M. (ed.): Genetikai variabilitás a növénynemesítésben. Mezőgazda Kiadó, Budapest
Heinze, B. 2007: A database of PCR primers for the chloroplast genomes of higher plants. Plant Methods 2007, 3: 4. http://www.plantmethods.com/content/3/I/4
Koltay Gy. és Kopecky F. 1954: Őshonos nyáraink leromlott öröklöttségének megjavítása. Erdészeti Kutatások 2: 65–86.
Lexer, C.; Fay, M.F.; Joseph, A.; Nica, M.S. and Heinze, B. 2005: Barrier to gene flow between two ecologically divergent Populus species, P. alba (white poplar) and P. tremula (European aspen): the role of ecology and life history in gene introgression. Molecular Ecology 14: 1045–1057.
Lexer, C.; Buerkle, C.A.; Joseph, J.A.; Heinze, B. and Fay, M.F. 2007: Admixture in European Populus hybrid zones makes feasible the mapping of loci that contribute the reproductive isolation and trait differences. Heredity (2007) 98: 74–84.
Lexer, C.; Joseph, J.; Loo, M. Van, Barbará, T.; Heinze, B.; Bartha D.; Castiglione, S.; Fay, M. and Buerkle, C. A. 2010: Genomic Admixture Analysis in European Populus spp. Reveals Unexpected Patterns of Reproductive Isolation and Mating. Genetics 186: 699–712.
Mátyás Cs. 2002a: A génszintű változatosság és elemzése. 15. In: Mátyás Cs. (ed.): Erdészeti – természetvédelmi genetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest
Mátyás Cs. 2002b: Az allélváltozatosság statisztikai elemzése. 35–40. In: Mátyás Cs. (ed.): Erdészeti – természetvédelmi genetika. Mezőgazda Kiadó, Budapest
Peakall, R. and Smouse, P.E. 2006: GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes 6: 288–295.
Podani J. 1997: Bevezetés a többváltozós biológiai adatfeltárás rejtelmeibe. Scientia Kiadó. Budapest p.145.
Sabatti, M.; D’Ovidio, R.; Tanzarella, O.A. és Scarascia Mugnozza, G.E. 2001: Assessment of geographic variation by RAPD markers among Italian open-pollinated progenies of Populus alba L. Genetic Resources and Crop Evolution 48(5): 423–428.
Sánchez, N.; Grau, J. M.; Alba, N.; Manzanera, J. A. and de los Angeles Bruno, M. 2000: Genetic Characterisation of Populus tremula Regions of Origin is Spain Using RAPD Fingerprints. Silvae Genetica 49(2): 66–71.
StatSoft, Inc. 2001. STATISTICA for Windows [Computer program manual]. Tulsa, OK: StatSoft, Inc., 2300 East 14th Street, Tulsa, OK 74104, phone: (918) 749-1119, fax: (918) 749;2217, email: info@statsoft.com, WEB: http://www.statsoft.com
##submission.downloads##
Megjelent
Hogyan kell idézni
Folyóirat szám
Rovat
License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
