Nyár genotípusok azonosítása DNS ujjlenyomatuk alapján
Kulcsszavak:
nyárfajták, mikroszatellit markerek, genetikai azonosítás, fajtavédelemAbsztrakt
Kutatásunk célja a nyár genotípusok molekuláris genetikai azonosítását lehetővé tevő módszer tesztelése volt. A kutatáshoz mikroszatellit (SSR) technikát választottunk, amely a növényi genomban nagy számban jelenlévő, ismétlődő szekvencia motívumok vizsgálatán alapul. Az alkalmazott kilenc marker segítségével az egyedek ujjlenyomatszintű azonosítása valósítható meg. Ennek megfelelően a genotípus adatok a fajtákra jellemző azonosító kódként használhatók. Amódszert 36, a nyárnemesítés szempontjából fontosabb nyárfajta, fajtajelölt és kísérleti klón példáján mutatjuk be. A módszer alkalmas lehet a jövőben a hazai nemesnyár fajták fajtavédelmében, szaporítóanyag felügyeletében történő alkalmazásra.
Hivatkozások
Fossati, T.; Zapelli, I.; Bisoffi, S.; Micheletti, A.; Vietto, L.; Sala F. and Castiglione, S. 2005: Genetic relationship and clonal identity in a collection of commercially relevant cultivars assessed by AFLP and SSR. Tree Genetics & Genomes. 1: 11–19.
Gergácz J. 2000: Helyzetkép a magyar erdészeti növénynemesítésről. Magkutatás, termesztés, kereskedelem, XIV. (1): 7–11.
Hajósné Novák M. (szerk.) 1999: Genetikai variabilitás a növénynemesítésben. Mezőgazda Kiadó. Budapest. p. 49.
Khasa, D.P.; Nadeem, S.; Thomas, B.; Robertson, A. and Bousquet, J. 2003: Application of SSR markers for parentage analysis of Populus clones. Forest Genetics 10(4): 273–281.
Peakall, R. and Smouse, P.E. 2006: GENALEX 6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes. 6: 288–295.
Podani J. 1997: Bevezetés a többváltozós biológiai adatfeltárás rejtelmeibe. Scientia Kiadó. Budapest. p. 145.
Rahman, M.H.; Dayananda, S. and Rajora, O.P. 2000: Microsatellite DNA markers in Populus tremuloides. Genome 43: 293–297.
Rajora, O.P. and Rahman, M.H. 2001: Microsatellite DNA markers and their usefulness in poplars and conservation of microsatellite DNA loci in Salicaceae. in Müller-Starck G. and Shubert R. (eds.) 2001: Genetic Response of Forest Systems to Changing Environmental Conditions. Vol. 70 (For. Sci.). 105–115.
Rajora, O.P. and Rahman, M.H. 2003: Microsatellite DNA and RAPD fingerprinting, identification and genetic relationship of hybrid poplar (Populus x canadensis) cultivars. Theoretical and Applied Genetics. 106: 470–477.
Rathmacher, G.; Niggemann, M.; Wypukol, H.; Gebhardt, K.; Ziegenhagen, B. and Bialozyt, R. 2009: Alleleic ladder and reference genotypes for a rigorous standardization of poplar microsatellite data. Trees. 23: 573–583.
van der Schoot, J.; Pospiskova, M.; Vosman, B. and Smulders, M.J.M. 2000: Development and characterization of microsatellite markers in black poplar (Populus nigra L.). Thoeretical Applied Genetics. 101 (1–2): 317–322.
Smulders, M.J.M.; van Der Schoot, J.; Arens, P. and Vosman, B. 2001: Trinucleotide repeat microsatellite markers for black poplar (Populus nigra L.). Molecular Ecology Notes 1(3): 188–190.
StatSoft, Inc. 2001: STATISTICA for Windows [Computer program manual]. Tulsa, OK: StatSoft, Inc., 2300 East 14th Street, Tulsa, OK 74104, phone: (918) 749-1119, fax: (918) 749–2217, email: info@statsoft.com, WEB: http://www.statsoft.com
Tuskan, G.A.; Gunter, L.E.; Yang, Z.K., Yin, T.M., Sewel, M.M. and DiFazio, S.P. 2004: Characterization of Microsatellites Revealed by Genomic Sequencing of Populus trichocarpa. Canadian Journal of Forest Research. 34(1): 85–93.
Weising, K.; Nybom, H.; Wolff, K. and Kahl, G. 2005: DNA Fingerprinting in Plants Principles, Methods and Applications. CRS Press. p. 42, 217. The International Populus Genome Consortium: http://www.ornl.gov/sci/ipgc/ssr_resource.html (2011-05-13)
##submission.downloads##
Megjelent
Hogyan kell idézni
Folyóirat szám
Rovat
License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
